Opis predmeta
|
Metoda, ki temelji na površinski plazmonski resonanci (ang. surface plasmon resonance, SPR) je sodobna biofizikalna analitska metoda za analizo interakcij med molekulami. Z metodo lahko analiziramo ali pride do interakcije in v realnem času okarakteriziramo kinetiko interakcij npr. med proteini, proteini in membranami, proteini in nukleinskimi kislinami, proteini in malimi molekulami (večjimi od 100 Da) in celo med proteini in virusi oziroma celimi celicami. V okviru teoretičnega dela predmeta študent spozna:
Študent praktično izvede zasnovo, izvedbo in analizo eksperimenta interakcije med izbranimi molekulami. |
Predmet učimo na programih
Cilji in kompetence
|
Pridobitev znanja o zmožnosti analiz interakcij med (makro)molekulami z aparatom na osnovi SPR. Zmožnost zasnove, izvedbe interakcij protein-protein, protein-membrana, protein-DNA, protein-RNA, protein-male učinkovine, celični lizat- protein ali virus-protein. Študent se nauči kritične analize izmerjenih lastnosti interakcij. |
Metode poučevanja in učenja
|
Konzultacije in pomoč pri zasnovi, izvedbi in analizi SPR eksperimenta izbrane interakcije med molekulami. V dogovoru z mentorjem kandidata je mogoča izvedba dela raziskav v sklopu kandidatove doktorske naloge študenta v infrastrukturnem centru za merjenje molekulskih interakcij. |
Predvideni študijski rezultati
|
Študent izvede individualno raziskovalno nalogo in na primeru spozna lastnosti aparata, ki deluje na principu površinske plazmonske resonance. Študent spozna kako zasnovati in analizirati pridobljene meritve – predvideni študijski rezultat je uspešna analiza izbrane interakcije med molekulami. Rezultati analiz študentu omogočijo zasnovo nadaljnjih poskusov, ki bi in vivo potrdili izsledke SPR analiz. |
Temeljni viri in literatura
|
Pregledni in izvirni članki iz področja. Review and original articles from the field.
|
Bodi na tekočem
Univerza v Ljubljani, Fakulteta za elektrotehniko, Tržaška cesta 25, 1000 Ljubljana